| SILAC+IP-MS-蛋白質(zhì)互作定量分析整體服務(wù) |
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上海創(chuàng)凌生物科技有限公司
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產(chǎn)品簡介
SILAC+IP-MS-蛋白質(zhì)互作定量分析整體服務(wù) 利用IP純化蛋白質(zhì)復(fù)合物時,除了能捕獲到Target蛋白及其互作蛋白之外,細(xì)胞中一些與抗體/抗體偶聯(lián)材料(agarose、magnetic beads等)高親和的蛋白質(zhì)也會被一起捕獲下來(非特異性粘附蛋白),并且這些蛋白都是高豐度的。 詳細(xì)介紹SILAC+IP-MS-蛋白質(zhì)互作定量分析整體服務(wù)簡介: 利用IP純化蛋白質(zhì)復(fù)合物時,除了能捕獲到Target蛋白及其互作蛋白之外,細(xì)胞中一些與抗體/抗體偶聯(lián)材料(agarose、magnetic beads等)高親和的蛋白質(zhì)也會被一起捕獲下來(非特異性粘附蛋白),并且這些蛋白都是高豐度的。故而,在后續(xù)的LC-MS鑒定時,這些非特性的蛋白質(zhì)會被高頻率的檢測到。這就帶來了一個很困擾的問題:由于沒有定量信息,在眾多鑒定到的蛋白質(zhì)中,如何才能排除非特性的粘附蛋白,找出真正的、與target特異性互作的蛋白。 將SILAC和IP技術(shù)相結(jié)合,借助SILAC引入質(zhì)量差異,IP完成后,蛋白質(zhì)復(fù)合物通過LC-MS分析,可同時完成定性(即鑒定,給出樣品中有那些蛋白質(zhì))和定量(給出每個蛋白質(zhì)被IP富集的相對程度)。根據(jù)定量結(jié)果結(jié)合軟件統(tǒng)計分析,即可直接區(qū)分出那些是target特異性的相互作用蛋白(SILAC ratio>1.0),那些是非特異性的粘附蛋白(SILAC ratio=1.0)。從而快速篩選和鎖定特異性的相互作用分子,后續(xù)生物學(xué)驗證成功率明顯提高。 技術(shù)和實驗方案”高、大、上“,能顯著提高文章的檔次。 SILAC+IP-MS-蛋白質(zhì)互作定量分析整體服務(wù)方案: 客戶只需提供基因名稱和細(xì)胞株即可,我方負(fù)責(zé)完成后續(xù)所有實驗,包括: 基因克隆與慢病毒制備。 穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建與鑒定。 細(xì)胞SILAC標(biāo)記及標(biāo)記效率檢測。 細(xì)胞擴增培養(yǎng)。 IP純化蛋白質(zhì)復(fù)合物并SDS-PAGE分離。 切割條帶,LC-MS測試分析。 MS數(shù)據(jù)定性和定量分析,依據(jù)SILAC的定量值(SILAC ratio)篩選潛在的互作蛋白。 挑選潛在的候選驗證蛋白(6個)進行后續(xù)驗證。承諾6個驗證蛋白,至少給出1個陽性的互作。 參考文獻: Nat Immunol 2014, 15(2):112-117. Proc Natl Acad Sci U S A 2014, 111(51):18219-18224. Science 2013, 340(6131):475-478. Nat Cell Biol 2013, 15(6):625-636. |
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